Dědková K., Vančurová L., Muggia L. & Steinová J. (2025) The plurality of photobionts within single lichen thalli. Symbiosis. (PDF)
Steinová J., Holien H., Košuthová A. & Škaloud P. (2022) An exception to the rule? Could photobiont identity be a better predictor of lichen phenotype than mycobiont identity? Journal of Fungi 8(3): 275. (PDF)
Škvorová Z., Černajová I., Steinová J., Peksa O., Moya P. & Škaloud P. (2022) Promiscuity in lichens follows clear rules: partner switching in Cladonia is regulated by climatic factors and soil chemistry. Frontiers in Microbiology 12: 781585. (PDF)
Černajová I., Schiefelbein U. & Škaloud P. (2022) Lichens from the littoral zone host diverse ulvophycean photobionts. Journal of Phycology 58: 267-280. (PDF)
Vančurová L., Malíček J., Steinová J. & Škaloud P. (2021) Choosing the right life partner: Ecological drivers of lichen symbiosis. Frontiers in Microbiology 12: 769304. (PDF)
Kosecka M., Guzow-Krzemińska B., Černajová I., Škaloud P., Jablońska A. & Kukwa M. (2021) New lineages of photobionts in Bolivian lichens expand our knowledge on habitat preferences and distribution of Asterochloris algae. Scientific Reports 11: 8701.
Černajová I. & Škaloud P. (2020) Lessons from culturing lichen soredia. Symbiosis: doi.org/10.1007/s13199-020-00718-4 (PDF)
Starosta J. & Svoboda D. (2020) Genetic variability in the Physconia muscigena group (Physciaceae, Ascomycota) in the Northern Hemisphere. Lichenologist 52:305-317. (PDF)
Vančurová L., Kalníková V., Peksa O., Škvorová Z., Malíček J., Moya P., Chytrý K., Černajová I. & Škaloud P. (2020) Symbiosis between river and dry lands: Phycobiont dynamics on river gravel bars. Algal Research 51: 102062.(PDF)
Černoušek T., Shrestha R., Kovářová H., Špánek R., Ševců A., Sihelská K., Kokinda J, Stoulil J., Steinová, J. (2020): Microbially influenced corrosion of carbon steel in the presence of anaerobic sulphate-reducing bacteria. Corrosion Engineering, Science and Technology 55(2): 127-137. (PDF)
Černajová I. & Škaloud P. (2019) The first survey of Cystobasidiomycete yeasts in the lichen genus Cladonia; with the description of Lichenozyma pisutiana gen. nov., sp. nov. Fungal Biology 123: 625-637. (PDF)
Steinová J. Škaloud, P., Yahr, R., Bestová, H. & Muggia, L. (2019) Reproductive and dispersal strategies shape the diversity of mycobiont-photobiont association in lichen symbioses.Molecular Phylogenetics and Evolution 134: 226-237. (PDF)
Němeček J., Steinová J. , Špánek R., Pluhař T., Pokorný P., Najmanová P., Knytl V. & Černík M. (2018) Thermally enhanced in situ bioremediation of groundwater contaminated with chlorinated solvents - a field test. Science of the total environment 622-623: 743-755. (PDF)
Lhotský O., Krákorová E., Linhartová L., Křesinová Z., Kašlík J., Steinová J. , Rødsand T., Filipová A., Petrů K., Kroupová K. & Cajthaml T. (2017) Pharmaceuticals, benzene, toluene and chlorobenzene removal from contaminated groundwater by combined UV/H2O2 photo-oxidation and aeration. Water research 120: 245-255. (PDF)
Lhotský O., Krákorová E., Mašín P., Žebrák R., Linhartová L., Křesinová Z., Steinová J. , Dvořák L., Rødsand T., Filipová A., Kroupová K., Wimmerová L., Kukačka J. & Cajthaml T. (2017) Assessment of biodegradation potential at a site contaminated by a mixture of BTEX, chlorinated pollutants and pharmaceuticals using passive sampling methods – case study. Science of the total environment 607: 1451-1465. (PDF)
Hofmeister J, Hošek J., Malíček J., Palice P., Syrovátková L., Steinová J. & Černajová I. (2016) Large beech (Fagus sylvatica) trees as 'lifeboats' for lichen diversity in central European forests. Biodiversity and conservation 25 (6): 1073-1090. (PDF)
Němeček J., Pokorný P., Lhotský O., Knytl V., Najmanová P., Steinová J. , Černík M., Filipová A., Filip J. & Cajthaml T. (2016) Combined nano-biotechnology for in-situ remediation of mixed contamination of groundwat.er by hexavalent chromium and chlorinated solvents. Science of the total environment 566: 822-834. (PDF)
Hofmeister J., Hošek J., Brabec M., Dvořák D., Beran M., Deckerová H., Burel J., Kříž M., Borovička J., Běťák J., Vašutová M., Malíček J., Palice Z., Syrovátková L., Steinová J. , Černajová I. , Holá E., Novozámská E., Čížek L., Iarema V., Baltaziuk K. & Svoboda T. (2015) Value of old forest attributes related to cryptogam species richness in temperate forests: A quantitative assessment. Ecological Indicators 57: 497-504. (PDF)
Škaloud P., Steinová J. , Řídká T., Vančurová L. & Peksa O. (2015) Assembling the challenging puzzle of algal biodiversity: species delimitation within the genus Asterochloris (Trebouxiophyceae, Chlorophyta). Journal of Phycology 51: 507-527. (PDF)
Černajová I. & Svoboda D. (2014) Lichen compounds of common epiphytic Parmeliaceae species deter gastropods both in laboratory and in Central European temperate forests. Fungal Ecology 11: 8-16. (PDF)
Neustupa J., Němcová Y., Veselá J., Steinová J. & Škaloud P. (2013) Leptochlorella corticola gen. et sp. nov. and Kalinella apyrenoidosa sp. nov.: two novel Chlorella-like green microalgae (Trebouxiophyceae, Chlorophyta) from subaerial habitats. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 63: 377-387. (PDF)
Neustupa J., Němcová Y., Veselá J., Steinová J. & Škaloud P. (2013) Parachloroidium gen. nov. (Trebouxiophyceae, Chlorophyta), a novel genus of coccoid green algae from subaerial corticolous biofilms. Phycologia 52: 411-421. (PDF)
Steinová J. , Stenroos S., Grube M. & Škaloud P. (2013) Genetic diversity and species delimitation of the zeorin-containing red-fruited Cladonia species (lichenized Ascomycota) assessed with ITS rDNA and β-tubulin data. Lichenologist 45: 665-684. (PDF)
Cardinale M., Steinová J. , Rabensteiner J., Berg G. & Grube M. (2012) Age, sun and substrate: triggers of bacterial communities in lichens. Enviromental Microbiology Reports 4: 23-28. (PDF)
Svoboda D. , Bouda F., Malíček J. & Hafellner J. (2012) A contribution to the knowledge of lichenized and lichenicolous fungi in Albania. Herzogia 25: 149-165. (PDF)
Svoboda D. , Peksa O. & Veselá J. (2011) Analysis of the species composition of epiphytic lichens in Central European oak forests. Preslia 83: 129-144. (PDF)
Svoboda D. , Peksa O. & Veselá J. (2010) Epiphytic lichen diversity in central European oak forests: Assessment of the effects of natural environmental factors and human influences. Environmental Pollution 158: 812-819. (PDF)
Svoboda D. (2007) Evaluation of the European method for mapping lichen diversity (LDV) as an indicator of environmental stress in the Czech Republic. Biologia 62: 424-431. (PDF)
Ghlimová H., Bouda F., Hauser T., Hlisnikovský D., Jerhot Š., Konečná E., Peksa O., Smolková A., Svoboda D. & Syrovátková L. (2023) Lišejníky zaznamenané během 25. jarního setkání bryologicko-lichenologické sekce ČBS u Mariánských Lázn&iiacute;. Bryonora 72: 12-23.
Bouda F., Konečná E., Malíček J., Svoboda D., Uhlík P. & Vondrák J. (2018) Lišejníky zaznamenané během 25. jarní ho setkání bryologicko-lichenologické sekce ČBS v Horažďovicích v dubnu 2018 [Lichens recorded during the 25th spring meeting of the Bryological and lichenological section of the CBS in Horažďovice, April 2018]. Bryonora 62: 40-52.
Kučera J., Herben T., Mikulášková E. & Svoboda D. (2018): Personalia: Prof. RNDr. Jiří Váňa, DrSc. (*11. 1. 1940 - ✝8. 4. 2018). Bryonora 61: 63-80.
Šoun J., Bouda F., Kocourková J., Malíček J., Palice Z., Peksa O., Svoboda D. & Vondrák J. (2017) Zajímavé nálezy lišejníků z čeledi Parmeliaceae v České republice [Interesting records of lichens of the family Parmeliaceae in the Czech Republic]. Bryonora 60: 46-64.
Lenzová V. & Svoboda D. (2015) Lišejníky Trubínského vrchu u Berouna. [Lichens of the Trubínský vrch hill near Beroun]. Bryonora 56: 72-80. (PDF)
Malíček J., Peksa O. & Steinová J. (2015) Lišejníky sutí v jižních Brdech [Lichens of boulder screes in the southern Brdy Hills]. Bryonora 56: 24-44. (PDF)
Peksa O., Bouda F., Halda J.P., Malíček J., Svoboda D. , Uhlík P. & Vondrák J. (2015) Lišejníky starých porostů Českého lesa. Český les 14: 41-45. (PDF)
Steinová J. , Bouda F., Malíček J., Palice Z., Peksa O., Svoboda D. & Vondrák J. (2015) Poznámky k rozšíření a ekologickým preferencím zástupců skupiny Cladonia coccifera v České republice. [Notes on distribution and ecological preferences of Cladonia coccifera group members in the Czech Republic]. Bryonora 55: 4-19. (PDF)
Šoun J., Bouda F., Kocourková J., Malíček J., Peksa O., Svoboda D. , Uhlík P. & Vondrák J. (2015) Lišejníky zaznamenané během jarního setkání Bryologicko-lichenologické sekce ČBS na Manětínsku (západní Čechy) v dubnu 2014. [Lichens recorded during the spring meeting of the Bryological and lichenological section CBS in the Manětín region (Western Bohemia), April 2014]. Bryonora, 55: 20-36. (PDF)
Malíček J. & Steinová J. (2014) Rostliny a lišejníky acidofilních stepí ve středním Povltaví. Vascular plants and lichens of acidophilous steppes in the Middle Vltava Region (Central Bohemia). Zprávy České botanické společnosti 49: 243-260. (PDF)
Svoboda D. , Halda J.P., Malíček J., Palice Z., Šoun J. & Vondrák J. (2014) Lišejníky Českého krasu: shrnutí výzkumů a soupis druhů. Lichens of the Český kras/Bohemian Karst (Central Bohemia, Czech Republic): a summary of previous surveys and a checklist of the area. Bohemia centralis 32: 213-265. (PDF)
Wagner B., Peksa O., Svoboda D. & Ritterová-Zelinková J. (2014) Lišejníky vrchu Lovoše v Českém středohoří [Lichens of the Lovoš Mt. (České středohoří Mts, Czech Republic)]. Bryonora 54: 1-10. (PDF)
Steinová J. , Bouda B., Halda J. P., Kukwa M., Malíček J., Müller A., Palice Z., Peksa O., Schiefelbein U., Svoboda D., Syrovátková L., Šoun J., Uhlík P. & Vondrák J. (2013) Lichens recorded during the 16th meeting of the bryological and lichenological section CBS in Slavkovský les mountains, April 2009. Bryonora 51: 1-14. (PDF)
Mikoláš M., Kalafusová I., Tejkal M., Černajová I. , Michalová Z. , Hlásny T. , Barka I., Zrníková K. , Bače R. , Svoboda M. (2013) Stav habitatu jadrovej populá cie hluchá ňa hôrneho (Tetrao urogallus ) v Zá padných Karpatoch: Je ešte pre hlucháňa na Slovensku miesto? [Habitat conditions of the core population of the Western Carpathians: is there still place for the species in Slovakia?]. Sylvia 49:79-98. (PDF)
Malíček J., Halda J. P., Kocourková J., Müller A., Palice Z., Peksa O. & Svoboda D. (2012): Lišejníky zaznamenané během podzimního bryologicko-lichenologického setkání v Labských pískovcích 2010. Bryonora 49: 17-23. (PDF)
Mayrhofer H., Malíček J., Rohrer A., Svoboda D. & Bilovitz P. O. (2012) New or otherwise interesting lichenized and lichenicolous fungi from Macedonia. Fritschiana 71: 1-35. (PDF)
Halda J. P., Bouda F., Fessová A., Kocourková J., Malíček J., Müller A., Peksa O., Svoboda D. , Šoun J. & Vondrák J. (2011) Lichens recorded during the autumnal bryo-lichenological meeting in Železné hory Mts (Czech Republic), September 2009 [Lišejníky zaznamenané během podzimního bryologicko-lichenologického setkání v CHKO Železné hory v září 2009]. Bryonora 47: 40-51. (PDF)
Malíček J., Černajová I. & Syrovátková L. (2011) Lišejníky v lesních porostech Svatojiřského lesa a PP Černý orel a okolí [Lichens in forests in areas of Svatojiřský les and in the surrounding of Černý orel Nature Monument (Central Bohemia)] . Muzeum a současnost 26: 3-12. (PDF)
Svoboda D. (2011) Lišejníky kolem nás. Roverský kmen 10/11: 45.
Svoboda D. (2007) Lichens of the central part of the Bohemian Karst. Novitates botanicae Universitatis Carolinae 18: 15-52. (PDF)
Svoboda D. (2007) Phaeophyscia hirsuta - a little known lichen in the Czech Republic. Graphis Scripta 19: 33-36. (PDF)